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Brote de coronavirus: NVIDIA abre su software de secuenciación del genoma a los investigadores

NVIDIA está abriendo el acceso a su software de secuenciación del genoma Parabricks a los investigadores que trabajan en el coronavirus de forma gratuita.

Coronavirus, Coronavirus NVIDIA, herramienta NVIDIA, NVIDIA Parabricks, herramientas Parabricks NVIDIABrote de coronavirus: NVIDIA ofrece a los investigadores acceso gratuito a su software de secuenciación del genoma. (Fuente de la imagen: NVIDIA)

NVIDIA está abriendo el acceso a su software de secuenciación del genoma Parabricks a los investigadores que trabajan en el coronavirus de forma gratuita. La herramienta será accesible para todos los investigadores que estén secuenciando los genomas de COVID-19 y los genomas de quienes padecen COVID-19, según un comunicado de prensa de la compañía.



NVIDIA dice que Parabricks puede reducir el tiempo de invocación de variantes en un genoma humano completo de dos días a solo una hora en un solo servidor, lo que brinda a los investigadores una herramienta poderosa con la que ayudar a comprender mejor el virus. La empresa otorgará una licencia gratuita de 90 días a Parabricks a cualquier investigador del mundo.

La herramienta utiliza las unidades de procesamiento de gráficos (GPU) de la empresa para acelerar el análisis de los datos de secuencia en cincuenta veces, según la empresa. Los investigadores que deseen acceder y tengan una GPU NVIDIA pueden completar el formulario y obtener la licencia. NVIDIA dice que extenderán la oferta según sea necesario y están monitoreando cómo evoluciona la pandemia.





Para los científicos que están tratando de encontrar una cura para el coronavirus, que a nivel mundial ha infectado a cerca de 200,000 personas, comprender la secuencia del genoma del virus es crucial, pero en la mayoría de los casos es un esfuerzo largo y que requiere mucho tiempo. Con herramientas como los Parabricks, puede ayudar a ahorrar tiempo, lo cual es un factor crítico en este momento considerando que la pandemia no muestra signos de detenerse.



La razón por la que la secuenciación del genoma se vuelve importante en los virus es porque muchos de estos experimentan cambios genéticos y, al rastrear los cambios genéticos, es posible saber qué vacunas funcionarán, si ha habido mutaciones y qué tratamiento será más efectivo. Por ejemplo, el sitio web de los Centros para el Control de Enfermedades (CDC) de EE. UU. Señala que los virus de la influenza están en constante evolución y el seguimiento de su código genético puede ayudar a mantener un mejor seguimiento.

Con el nuevo COVID-19, esta es una nueva cepa y se cree que forma parte de la familia de los coronavirus, que causan el resfriado común, el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV) y el síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV). Pero la cepa COVID-2019 es una que no se ha estudiado previamente y, por lo tanto, el seguimiento del genoma puede dar una imagen más clara de este virus.

Anteriormente se informó que el I BM's Summit, que es la supercomputadora más poderosa del mundo , también se utilizó para ayudar a ejecutar simulaciones para comprender qué compuestos químicos funcionarían mejor contra el virus.